• 崇左市发展改革委（物价局、粮食局、人防办）
• 崇左市工业和信息化委
• 崇左市教育局
• 崇左市科学技术和知识产权局
• 崇左市民族和宗教委（含民语委）
• 崇左市公安局
• 崇左市民政局
• 崇左市司法局
• 崇左市财政局
• 崇左市人力资源社会保障局（含社保局）
• 崇左市国土资源局
• 崇左市环境保护局
• 崇左市住房城乡建设委（含广西崇左花山国家级风景名胜区管理局）
• 崇左市交通运输局
• 崇左市水利局
• 崇左市农业局（水产畜牧兽医局、含动物卫生监督所）
• 崇左市林业局
• 崇左市商务和口岸委
• 崇左市文化新闻出版广电局（体育局）
• 崇左市卫生计生委
• 崇左市审计局
• 崇左市外侨办
• 崇左市旅游发展委
• 崇左市安全监管局
• 崇左市食品药品监管局（食品安全委员会办公室）
• 崇左市统计局
• 崇左市规划局
• 崇左市工商局
• 崇左市质监局
• 崇左市档案局
• 崇左市农机中心（农机局）
• 崇左市住房公积金管理中心
• 崇左市保密局
• 崇左市地震局

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